吕秀才后来是一妻一妾吗

不是。

在《武林外传》电影中，吕秀才做了青州知府，接着升职户部侍郎，秀才和正妻小郭有两女，长女吕青柠，次女吕青橙，没有小妾。

在《武林外传》电影版中秀才和小郭有了自己幸福的小窝，无双和小六也走到了一起。