按时间顺序对玄武、云志、云之瑶的情节进行总结和梳理，并说明情节之间的关系。

游戏讲述了一个地球上的年轻人(游戏中称之为“轩辕界”)陆承玄(转世为上古神器“昊天宝塔”)，因精神失控杀死父母而被家人赶走，最后绝望的想要跳崖自杀。这时，“皇甫暮云”(转世为轩辕剑)用一把古斧打开了轩辕界与“山海界”之间的通道，陆承玄掉了进去。之后的三月，皇甫牧云教了主角一些基本剑法，因有要事暂时离开主角。游戏开始了。因为山海的天气越来越热，茂名人到处寻找食物。主角担心皇甫暮云会被抢走当食物，便恳求自己以前救过的茂民“福”帮忙。傅感激不尽，为他带路，到毛民国的牢房一探究竟。途中遇到前来救友的“女儿国”二主“夏柔”(东皇钟转世)。牢房里关着莫邪，夏柔即将被献祭的“青龙国”。傅因为帮助外人，被迫出国，跟随主角。莫邪认为主角有些潜质，可以用青龙国的圣物“余省盘”来感应，是“圣人要找的人”(夏柔之前也是这么认为的)，要主角一起去见圣人。途经“边仁国”，将加入想去青龙国找药材救老婆的“玄武国”汉洛收入队伍。

一群人来到青龙国，贤者通过测试确定夏柔是合适的人选，并告诉大家天气变热是因为“朱雀国”要统治山海，打破古印，放出猛兽。请大家再次寻找28颗可以封印野兽的“星曜石”(以28颗星命名)。

通过宣武国，得知汉洛叔勾结朱雀国篡位。本质是朱雀国企在努力推进战线。韩洛陪主角去女儿国，请求增援。在白虎王国和刁蛮王国的帮助下，朱雀王国战败而逃。白虎王国决定追求胜利，所有人都来到了战争的前线。得知战争真相后，主角决定直接潜入朱雀国。在地宫中，朱雀皇帝被发现正在释放被封印的朱雀圣兽。当所有人都在和朱雀皇帝战斗的时候，一个青衣女人(严清)出现了，带走了神圣的朱雀兽。原来青龙圣人说朱雀圣兽造成天文异常是不对的。事实上，这个青衣女人想用圣兽的力量来解开她的封印。

清昊为了报仇，在获得他的真身后，将青龙、白虎、朱雀、玄武四国全部消灭，并扬言要在消灭山海边界后继续消灭轩辕。在大家的帮助下，主角来到了山海分界线的中心区域。打败青昊，让青昊意识到自己的怨恨源于一场误会。最后，清昊自愿接受了印章。

原来，在两鹿大战期间，青昊深爱着黄帝。为了帮助他对抗蚩尤，她偷走了轩辕剑，消耗了自己的力量，导致战后一个地区持续干旱。对于轩辕人来说，黄帝用东皇钟创造了一个新世界，忍痛将清漪和战败的颜地部落迁入其中。随后，青龙、白虎、朱雀、玄武也把她赶走，封了她。从此，青昊误以为自己付出了一切却得到这样的下场，决心报仇。

平凡的结局，从大家进入朱雀王国地宫开始。朱雀帝已经被皇甫晚云和青昊击中，青昊正要解开朱雀圣兽的封印，大家都去阻止。皇甫牧云试图用武力阻止主角的行动来保护清浩，但他做不到。这时候青昊打了皇甫，放出圣兽和大家一起战斗。清昊战败而死。皇甫为了报仇，邀请主角单挑。最终，同归于尽。

“轩辕剑三外传的根据？在《天痕》一段对话的描述中，‘剑’和‘塔’一度失去了力量，无法恢复人形。还没有玩过隐藏结局的玩家认为是正统，但是在隐藏结局中，剑塔全部失去了力量，剑塔被剑杀死，然后借助钟健的力量重生，然后剑塔自我毁灭作为证明黄帝后悔的证据，这也符合剑塔曾经失去力量，后来DOMO的事实。

根据轩辕剑外传？《汉书之云》结尾，夏柔把轩辕剑送了回来。如果是一般的结局，夏柔不太可能把轩辕剑送回去，因为无法理解女神背后的故事，产生了恨的念头。但如果结局被古月圣人的话所隐藏和矛盾，那就真的很难决定正统的结局了。

主角在山海中经历的国家有:毛共和国、苗人国、木易国、周饶国、青龙国、玄武国、女儿国、白虎国、长臂国、厌火国、朱雀国、齐臂国。