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1996年（1—42）
1?云霄飞车杀人事件?B/S?
2?董事长千金绑架事件?
3?偶像密室杀人事件?
4?大都会暗号地图事件?
5?新干线大爆破事件?
6?情人节杀人事件◆?
7?每月一件礼物威胁事件?
8?美术馆杀人事件?
9?天下第一夜祭杀人事件?
10?足球选手恐吓事件?
11?钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件★?
12?步美被绑架事件?
13?奇怪的寻亲杀人事件?
14?谜样的讯息狙击事件◆?
15?消失的尸体杀人事件?
16?古董收藏家杀人事件?
17?百货公司挟持事件◆?
18?六月新娘杀人事件?
19?电梯杀人事件◆?
20?鬼屋杀人事件?
21?电视台外景队杀人事件◆?
22?豪华客轮连续杀人事件（前篇）?
23?豪华客轮连续杀人事件（后篇）?
24?丧失记忆的美女事件◆?
25?真假人质绑票事件◆?
26?爱犬约翰杀人事件◆?
27?小五郎同学会杀人事件（前篇）?
28?小五郎同学会杀人事件（后篇）?
29?计算机杀人事件◆?
30?不在场证明杀人事件◆?
31?电视台杀人事件?
32?咖啡厅杀人事件?
33?侦探团生还事件◆?
34?山庄绷带怪人杀人事件（前篇）?
35?山庄绷带怪人杀人事件（后篇）?
36?星期一晚上7:30杀人事件◆?
37?仙人掌花杀人事件◆?
38?赤鬼村火祭杀人事件?
39?企业家千金杀人事件（前篇）?
40?企业家千金杀人事件（后篇）?
41?优胜锦旗被割事件◆?
42?卡拉OK厅杀人事件?
1997年（43－85）? 43?江户川柯南诱拐事件?
44?堀田三兄弟杀人事件◆?
45?敷面膜杀人事件◆?
46?雪山山庄杀人事件?
47?健身俱乐部杀人事件◆?
48?外交官杀人事件（前篇）?X?
49?外交官杀人事件（后篇）?S/X?
50?图书馆杀人事件?
51?高尔夫练习场杀人事件◆?
52?雾天狗传说杀人事件★?
53?神秘凶器杀人事件◆?
54?电玩公司杀人事件?B?
55?列车手法杀人事件◆?
56?清洁车杀人事件◆?
57?福尔摩斯迷杀人事件（前篇）?X?
58?福尔摩斯迷杀人事件（后篇）?X?
59?首次跑腿杀人事件◆?
60?插画画家杀人事件?
61?幽灵船杀人事件（前篇）◆?
62?幽灵船杀人事件（后篇）◆?
63?大怪兽哥梅拉杀人事件?
64?第三个指纹杀人事件◆?
65?螃蟹和鲸鱼绑架事件◆?
66?夜路杀人事件◆?
67?舞台女演员杀人事件◆?
68?暗夜男爵杀人事件（事件篇）?
69?暗夜男爵杀人事件（疑惑篇）?
70?暗夜男爵杀人事件（解决篇）?
71?米花之狼杀人事件◆?
72?三胞胎别墅杀人事件?
73?少年侦探队遇难事件◆?
74?死神阵内杀人事件◆?
75?金融公司社长杀人事件?
76?柯南VS怪盗基德★?K?
77?名门连续惨死事件（前篇）?X?
78?名门连续惨死事件（后篇）?X?
79?银行强盗杀人事件◆?
80?流浪画家杀人事件◆?
81?当红歌星绑架事件（前篇）?
82?当红歌星绑架事件（后篇）?
83?综合医院杀人事件◆?
84?滑雪别墅杀人事件（前篇）?
85?滑雪别墅杀人事件（后篇）?
1998年（86－128）? 86?诱拐现场特定事件◆（该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编，并非青山刚昌的原作）?
87?白鹤报恩杀人事件◆?
88?德休拉别墅杀人事件（前篇）◆?
89?德休拉别墅杀人事件（后篇）◆?
90?花香杀人事件◆?
91?抢匪住院事件?
92?恐怖登山杀人事件（前篇）◆?
93?恐怖登山杀人事件（后篇）◆?
94?雪女传说杀人事件◆?
95?小五郎约会杀人事件◆?
96?走投无路的名侦探！连续两大杀人事件★?
97?离别美酒杀人事件◆?
98?名陶艺家杀人事件（前篇）?
99?名陶艺家杀人事件（后篇）?
100?初恋情人回忆事件（前篇）?
101?初恋情人回忆事件（后篇）?
102?古装演员杀人事件（前篇）?
103?古装演员杀人事件（后篇）?
104?盗贼集团别墅事件（前篇）?
105?盗贼集团别墅事件（后篇）?
106?新闻照片杀人事件◆?
107?鼹鼠星人之谜事件（前篇）◆?
108?鼹鼠星人之谜事件（后篇）◆?
109?侦探团大追击事件◆?
110?烹饪教室杀人事件（前篇）◆?
111?烹饪教室杀人事件（后篇）◆?
112?帝丹小学七大离奇事件?
113?白色海滩杀人事件◆（该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》第1卷改编，并非青山刚昌的原作）?
114?有氧潜水杀人事件（前篇）?
115?有氧潜水杀人事件（后篇）?
116?推理小说家失踪事件（前篇）?
117?推理小说家失踪事件（后篇）?X?
118?浪花连续杀人事件★?X?
119?假面超人杀人事件◆?
120?蜜蜂鸡尾酒杀人事件◆?
121?浴室密室事件（前篇）?
122?浴室密室事件（后篇）?
123?天气预报小姐绑架事件◆?
124?神秘的狙击者杀人事件（前篇）◆?
125?神秘的狙击者杀人事件（后篇）◆?
126?旅行戏团杀人事件（前篇）◆?
127?旅行戏团杀人事件（后篇）◆?
128?黑衣组织10亿元抢劫事件◆?B?
1999年（129－173）? 129?来自黑暗组织的女子?大学教授杀人事件★?B?
130?竞技场无差别胁迫事件（前篇）?
131?竞技场无差别胁迫事件（后篇）?
132?魔术爱好者杀人事件（事件篇）?K?
133?魔术爱好者杀人事件（疑惑篇）?K?
134?魔术爱好者杀人事件（解决篇）?K?
135?消失的凶器搜索事件◆?
136?蓝色古堡探索事件（前篇）?
137?蓝色古堡探索事件（后篇）?
138?最终播映杀人事件（前篇）?
139?最终播映杀人事件（后篇）?
140?SOS！步美传达的讯息◆?
141?结婚前夕密室事件（前篇）?X?
142?结婚前夕密室事件（后篇）?X?
143?疑惑的天体观测◆?
144?上野出发的北斗星3号（前篇）?
145?上野出发的北斗星3号（后篇）?
146?本厅刑事恋爱物语（前篇）?
147?本厅刑事恋爱物语（后篇）?
148?路上电车紧急刹车事件◆?
149?游乐园高空弹跳事件◆?
150?汽车爆炸事件的真相（前篇）◆?
151?汽车爆炸事件的真相（后篇）◆?
152?神秘老人失踪事件◆?
153?园子危险的夏日物语（前篇）?
154?园子危险的夏日物语（后篇）?
155?水中钥匙密室事件◆?
156?本厅刑事恋爱物语2（前篇）?
157?本厅刑事恋爱物语2（后篇）?
158?沉默的环状线◆?
159?诡异的五重塔传说（前篇）◆?
160?诡异的五重塔传说（后篇）◆?
161?流经流水亭的杀机◆?
162?飞天密室?工藤新一最初的事件★?S?
163?月亮、星星与太阳的秘密（前篇）?
164?月亮、星星与太阳的秘密（后篇）?
165?少年侦探队消失事件◆?
166?鸟取县蜘蛛公馆的怪事（事件篇）?X?
167?鸟取县蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇）?X?
168?鸟取县蜘蛛公馆的怪事（解决篇）?X?
169?维纳斯之吻◆?
170?黑暗中的死角（前篇）?
171?黑暗中的死角（后篇）?
172?复活的死亡讯息（前篇）?
173?复活的死亡讯息（后篇）?
2000年（174－218）? 174?二十年的杀意?新佛尼号连续杀人事件★?X?
175?惨遭四次杀害的男子◆?
176?与黑暗组织的再会（灰原篇）?B?
177?与黑暗组织的再会（柯南篇）?B?
178?与黑暗组织的再会（解决篇）?B?
179?咖啡厅卡车撞入事件◆?
180?红色杀机梦幻曲（前篇）◆?
181?红色杀机梦幻曲（后篇）◆?
182?九道门大搜查◆?
183?危险的食谱◆?
184?诅咒假面的冷笑★◆?
185?名侦探遇害记（前篇）◆?
186?名侦探遇害记（后篇）◆?
187?黑暗中传来的神秘枪响◆?
188?危命的复活?侦探队洞窟遇难记?
189?危命的复活?名侦探负伤记?X?
190?危命的复活?第三个选择?X?
191?危命的复活?黑衣骑士?S/X?
192?危命的复活?新一回来了?S/X?
193?危命的复活?约定的地点?S?
194?别有玄机的八音盒（前篇）?
195?别有玄机的八音盒（后篇）?
196?看不见的凶器?小兰的初次推理◆?
197?超级跑车的陷阱（前篇）◆?
198?超级跑车的陷阱（后篇）◆?
199?毛利小五郎涉嫌记（前篇）?
200?毛利小五郎涉嫌记（后篇）?
201?第十位乘客（前篇）◆?
202?第十位乘客（后篇）◆?
203?黑色伊卡洛斯之翼（前篇）◆?
204?黑色伊卡洛斯之翼（后篇）◆?
205?本厅刑事恋爱物语3（前篇）?
206?本厅刑事恋爱物语3（后篇）?
207?太顺利的推理◆?
208?通往迷宫的入口?巨大神像的愤怒★◆?
209?龙神山坠崖事件◆?
210?五彩传说的水中豪宅（前篇）◆?
211?五彩传说的水中豪宅（后篇）◆?
212?蘑菇、熊与侦探队（前篇）?
213?蘑菇、熊与侦探队（后篇）?
214?怀古饭店的神秘事件◆?
215?复仇海滩（前篇）◆?
216?复仇海滩（后篇）◆?
217?目暮警官尘封的秘密（前篇）?
218?目暮警官尘封的秘密（后篇）?
2001年（219－262）? 219?被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德★?S/K（前半集“钟楼对决”根据《魔术快斗》漫画第4卷“漆黑之星”篇改编，并非改编自《名侦探柯南》漫画）?
220?满口谎言的委托人（前篇）?
221?满口谎言的委托人（后篇）?X?
222?人鱼失踪记（事件篇）?X?
223?人鱼失踪记（推理篇）?X?
224?人鱼失踪记（解决篇）?X?
225?生意兴隆的秘密◆?
226?格斗游戏的陷阱（前篇）?F?
227?格斗游戏的陷阱（后篇）?F?
228?暗藏杀机的陶艺教室（前篇）?
229?暗藏杀机的陶艺教室（后篇）?
230?神秘的乘客（前篇）?B/F?
231?神秘的乘客（后篇）?B/F?
232?公寓坠楼事件◆?
233?未消失的证据（前篇）?
234?未消失的证据（后篇）?
235?地下酒窖密室◆?
236?南纪白滨的神秘之旅（前篇）◆?
237?南纪白滨的神秘之旅（后篇）◆?
238?大阪3K事件（前篇）?X?
239?大阪3K事件（后篇）?X?
240?新干线护送事件（前篇）?X?
241?新干线护送事件（后篇）?
242?元太的灾难?
243?毛利小五郎的冒充者（前篇）?
244?毛利小五郎的冒充者（后篇）?
245?向日葵馆的枪声◆?
246?陷入网中的谜团（前篇）?
247?陷入网中的谜团（后篇）?
248?疗养森林的不在场证明◆?
249?偶像们的秘密（前篇）?
250?偶像们的秘密（后篇）?
251?OK牧场的悲剧◆?
252?画中的绑匪◆?
253?本厅刑事恋爱物语4（前篇）?
254?本厅刑事恋爱物语4（后篇）?F?
255?松江玉造连句大战十四回合（前篇）◆?
256?松江玉造连句大战十四回合（后篇）◆?
257?匪夷所思的天谴◆?
258?来自芝加哥的男子（前篇）?F?
259?来自芝加哥的男子（后篇）?F?
260?摇晃的餐厅◆?
261?雪夜的恐怖传说（前篇）◆?
262?雪夜的恐怖传说（后篇）◆?
2002年（263－303）? 263?大阪双重谜团?浪花剑士和太阁城★?X?
264?法庭的对决?妃英理vs小五郎（前篇）◆?
265?法庭的对决?妃英理vs小五郎（后篇）◆?
266?情人节的真相（事件篇）?
267?情人节的真相（推理篇）?F?
268?情人节的真相（解决篇）?
269?犯罪的遗物（前篇）?
270?犯罪的遗物（后篇）?F?
271?情急之下的应变之道（前篇）?F?
272?情急之下的应变之道（后篇）?B/F?
273?猜谜婆婆失踪事件◆?
274?幽灵屋的真相（前篇）?B?
275?幽灵屋的真相（后篇）?
276?警察手册丢失事件◆?
277?英语教师VS西部名侦探（前篇）?F/X?
278?英语教师VS西部名侦探（后篇）?F/X?
279?疯狂足球迷（前篇）?
280?疯狂足球迷（后篇）?
281?小小的目击者◆?
282?水流石庭的玄机（前篇）◆?
283?水流石庭的玄机（后篇）◆?
284?中华街的雨中幻影（前篇）?F?
285?中华街的雨中幻影（后篇）?
286?工藤新一纽约事件（事件篇）?B/S?
287?工藤新一纽约事件（推理篇）?B/S?
288?工藤新一纽约事件（解决篇）?B/F/S?
289?光彦森林迷失记（前篇）?B?
290?光彦森林迷失记（后篇）?B?
291?孤岛的公主与海龙宫（事件篇）?X?
292?孤岛的公主与海龙宫（探索篇）?X?
293?孤岛的公主与海龙宫（解决篇）?X?
294?爱与决断的冲击（前篇）◆?
295?爱与决断的冲击（后篇）◆?
296?屋形船海钓记◆?
297?法庭的对决Ⅱ?妃英理VS九条（前篇）◆?
298?法庭的对决Ⅱ?妃英理VS九条（后篇）◆?
299?关门海峡的友情与杀机（前篇）◆?
300?关门海峡的友情与杀机（后篇）◆?
301?恶意与圣者的游行（前篇）?
302?恶意与圣者的游行（后篇）?
303?被害人回来了◆?
2003年（304－344）? 304?震动的警视厅?1200万名人质★?
305?看不见的嫌疑犯（前篇）?
306?看不见的嫌疑犯（后篇）?
307?残留下来的无声证言（前篇）?B?
308?残留下来的无声证言（后篇）?B/F?
309?接触黑色组织（交涉篇）?B/F?
310?接触黑色组织（追踪篇）?B?
311?接触黑色组织（决死篇）?B/F?
312?夕阳染红的女儿节娃娃（前篇）?
313?夕阳染红的女儿节娃娃（后篇）?
314?扶手损毁的瞭望台◆?
315?阳光普照的地方◆?
316?被玷污的蒙面英雄（前篇）?
317?被玷污的蒙面英雄（后篇）?
318?幸运的雪茄盒（前篇）◆?
319?幸运的雪茄盒（后篇）◆?
320?忍术制造不在场证明之法◆?
321?消失的绑架逃逸车（前篇）◆?
322?消失的绑架逃逸车（后篇）◆?
323?服部平次一筹莫展！（前篇）?X?
324?服部平次一筹莫展！（后篇）?X?
325?火焰中的红马（事件篇）?X?
326?火焰中的红马（搜查篇）?X?
327?火焰中的红马（解决篇）?X?
328?生日葡萄酒之谜◆?
329?金钱买不到的友情（前篇）?
330?金钱买不到的友情（后篇）?
331?充满疑惑的辣味咖喱（前篇）?
332?充满疑惑的辣味咖喱（后篇）?
333?相似的两位公主（前篇）?
334?相似的两位公主（后篇）?
335?东都现象所的秘密（前篇）?F?
336?东都现象所的秘密（后篇）?F?
337?坠落事件的内幕◆?
338?四辆保时捷（前篇）?F?
339?四辆保时捷（后篇）?B/F?
340?厕所里隐藏的秘密（前篇）?B?
341?厕所里隐藏的秘密（后篇）?B?
342?豪斯登堡的新娘★◆?
343?便利商店的陷阱（前篇）?F?
344?便利商店的陷阱（后篇）?F?
2004年（345－383）? 345?与黑衣组织直面对决?满月之夜的双重谜案★?B/F/X?
346?寻找屁股上的印记（前篇）?F?
347?寻找屁股上的印记（后篇）?F?
348?爱、幽灵和地球遗产（前篇）◆?
349?爱、幽灵和地球遗产（后篇）◆?
350?被遗忘的手机（前篇）?
351?被遗忘的手机（后篇）?
352?钓鱼大赛的悲剧（前篇）◆?
353?钓鱼大赛的悲剧（后篇）◆?
354?小小的委托人（前篇）?
355?小小的委托人（后篇）?
356?怪盗基德令人惊异的空中漫步★?K?
357?恋人是春天的幻影◆?
358?本厅刑事恋爱物语5（前篇）?
359?本厅刑事恋爱物语5（后篇）?
360?不可思议的春季甲虫◆?
361?帝丹高中校园灵异事件（前篇）?
362?帝丹高中校园灵异事件（后篇）?F?
363?都市的乌鸦◆?
364?心灵相通杀人事件（前篇）◆?
365?心灵相通杀人事件（后篇）◆?
366?众目睽睽之下的码头惨剧（前篇）?
367?众目睽睽之下的码头惨剧（后篇）?
368?魔女栖息的糖果之家◆?
369?幸运儿疑案◆?
370?失而复得的游戏软件◆?
371?沉默的航线（前篇）?
372?沉默的航线（后篇）?
373?剧毒蜘蛛的陷阱◆?
374?星星和香烟的暗号（前篇）?
375?星星和香烟的暗号（后篇）?
376?限时15时◆?
377?桃太郎解谜之旅（前篇）◆?
378?桃太郎解谜之旅（后篇）◆?
379?温泉雪夜长袖和服事件（前篇）◆?
380?温泉雪夜长袖和服事件（后篇）◆?
381?谁的推理秀（前篇）?X?
382?谁的推理秀（后篇）?X?
383?甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔★?X?
2005年（384－424）? 384?目标毛利小五郎◆?
385?斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（前奏曲）?
386?斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（间奏曲）?
387?斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（尾奏曲）?
388?醉倒在萨摩的小五郎（前篇）◆?
389?醉倒在萨摩的小五郎（后篇）◆?
390?本厅刑事恋爱物语6（前篇）?
391?本厅刑事恋爱物语6（后篇）?
392?谜样的身高差距20厘米◆?
393?疑似绑架案件◆?
394?奇异屋宇大冒险（封印篇）?K?
395?奇异屋宇大冒险（机关篇）?K?
396?奇异屋宇大冒险（解决篇）?K?
397?辛辣苦口的甜美果汁◆?
398?奇妙一家的委托（前篇）?
399?奇妙一家的委托（后篇）?
400?心存疑惑的小兰◆?S?
401?珠宝强盗现行犯（前篇）?
402?珠宝强盗现行犯（后篇）?
403?诡异的天使之馆（前篇）◆?
404?诡异的天使之馆（后篇）◆?
405?去叫救护车的男子◆?
406?柯南和平次的推理魔术（机关篇）?X?
407?柯南和平次的推理魔术（宅第篇）?X?
408?柯南和平次的推理魔术（解决篇）?X?
409?舞台剧和绑架案同步进行（前篇）◆?
410?舞台剧和绑架案同步进行（后篇）◆?
411?神社鸟居之惊人暗号（前篇）?
412?神社鸟居之惊人暗号（后篇）?
413?完全半分犯罪之谜◆?
414?侦探团青鸟追踪记◆?
415?佛灭日出现的恶灵（事件篇）?
416?佛灭日出现的恶灵（疑惑篇）?
417?佛灭日出现的恶灵（解决篇）?
418?米花町阁楼之家◆?
419?八岐大蛇的剑（前篇）◆?
420?八岐大蛇的剑（后篇）◆?
421?银杏色的初恋（前篇）?
422?银杏色的初恋（后篇）?
423?侦探团和毛虫四兄弟◆?
424?小丑发来的彩信◆ 425?黑色冲击！组织魔爪伸来的瞬间★?B/F/C?
426?给小兰的情书◆?
427?充满神秘的上学路（前篇）?
428?充满神秘的上学路（后篇）?
429?无法回头的二人（前篇）?C?
430?无法回头的二人（后篇）?
431?本厅刑事恋爱物语7（前篇）?
432?本厅刑事恋爱物语7（后篇）?
433?柯南怪小孩◆?
434?名犬Cool的功劳◆?
435?侦探团的特别专访（前篇）?
436?侦探团的特别专访（后篇）?
437?上户彩与新一?4年前的约定◆?S?
438?鱼邮件追踪记?
439?然后谁都无须存在了◆?
440?极限赛车表演◆?
441?通向死亡的“啊”◆?
442?被钢筋阻止的男人◆?
443?叹气拾潮（前篇）?
444?叹气拾潮（后篇）?
445?俄罗斯蓝猫的秘密?
446?被封印的欧式窗（前篇）?
447?被封印的欧式窗（后篇）?
448?目黑的秋刀鱼事件◆?
449?本厅刑事恋爱物语?虚假的婚礼★?
450?诡计VS魔术（前篇）◆?
451?诡计VS魔术（后篇）◆?
452?金毗罗剧院魅影★◆?
453?因缘与友情的试映会?
454?颠倒的结局（前篇）?
455?颠倒的结局（后篇）?
456?我最爱的推理◆?
457?园子的红手帕（前篇）?
458?园子的红手帕（后篇）?
459?怪人?循规蹈矩的男人◆?
2007年（460－490）? 460?一年B班大作战?
461?消失的一页◆?
462?黑暗组织的影子?小小的目击者?B/F/C?
463?黑暗组织的影子?奇妙的照明?
464?黑暗组织的影子?谜样的高额报酬?B?
465?黑暗组织的影子?珍珠流星?B?
466?打不破的雪人（前篇）?
467?打不破的雪人（后篇）?
468?池塘边的怪事件◆?
469?怪盗基德与四幅名画（前篇）?K?
470?怪盗基德与四幅名画（后篇）?K?
471?失控的租赁汽车◆?
472?工藤新一少年冒险（前篇）?S/K?
473?工藤新一少年冒险（后篇）?S/K?
474?妃英理律师之恋?
475?厄运大奖◆?
476?元太的必杀球（前篇）?
477?元太的必杀球（后篇）?
478?真实的30分钟◆?
479?和服部平次***度的3天★?C/X?
480?黄色的不在场证明◆?
481?山妖婆婆的利刃（前篇）?
482?山妖婆婆的利刃（后篇）?
483?消失的巡警◆?
484?黑色照片的去向（前篇）?B/X?
485?黑色照片的去向（后篇）?B/C?
486?从右至左的招财猫◆?
487?本厅刑事恋爱物语8?左手的无名指★?
488?电视台的恶魔★?
489?法庭的对决Ⅲ?目击者是检察官★◆?
490?服部平次VS工藤新一?滑雪场的推理对决★?S/X?
2008年（491－520）? 491?红与黑的碰撞?开端?B/F/C/X?
492?红与黑的碰撞?血缘?B/F/C?
493?红与黑的碰撞?绝叫?B/F/C?
494?红与黑的碰撞?冥土?B/F/C?
495?红与黑的碰撞?昏睡?B/F/C?
496?红与黑的碰撞?侵入?B/F/C?
497?红与黑的碰撞?觉醒?B/F/C?
498?红与黑的碰撞?搅乱?B/F/C?
499?红与黑的碰撞?伪装?B/F/C?
500?红与黑的碰撞?遗言?B/F/C?
501?红与黑的碰撞?嫌疑?B/F/C?
502?红与黑的碰撞?洁白?B/F/C?
503?红与黑的碰撞?决死?B/F/C?
504?红与黑的碰撞?殉职?B/F/C?
505?律师妃英理的证言（前篇）?
506?律师妃英理的证言（后篇）?
507?卡拉OK包房的死角（前篇）?
508?卡拉OK包房的死角（后篇）?
509?红白黄色与侦探团?F/C?
510?柯南VS双重暗号之谜?
511?推理对决！新一VS冲矢昴?
512?破碎的星座图◆?
513?杀意源自咖啡之香（前篇）?
514?杀意源自咖啡之香（后篇）?
515?怪盗基德的瞬间移动魔术★?X/K?
516?风林火山?迷宫的铠甲武士★?X?
517?风林火山?阴和雷霆的对决?X?
518?明治维新神秘之旅（探索篇）◆?
519?明治维新神秘之旅（解读篇）◆?
520?酒红色的告发◆?
2009年（521－561）? 521?杀人犯?工藤新一★?S/X?
522?新一的真实身份与小兰的眼泪★?S/X?
523?真正想问的事?S/X?
524?憎恨的蓝色火花（前篇）?X?
525?憎恨的蓝色火花（后篇）?
526?真凶送来的礼物?
527?假面戏剧中隐藏的恶意◆?
528?以柔制谜（前篇）?
529?以柔制谜（后篇）?
530?都市传说的真相（前篇）?
531?都市传说的真相（后篇）?
532?初恋的伤痕?
533?呼唤过去的伤痕?
534?新伤痕与吹口哨的男人?
535?旧伤痕与刑警之魂?
536?消失的名画背后的秘密◆?
537?怪盗基德VS最强金库（前篇）?K?
538?怪盗基德VS最强金库（后篇）?K?
539?给愚蠢者的遗产◆?
540?毛利小五郎停业的日子（前篇）◆?
541?毛利小五郎停业的日子（后篇）◆?
542?鱼儿消失的一角岩（前篇）?
543?鱼儿消失的一角岩（后篇）?
544?弹奏不和谐音符之手◆?
545?雾中尖叫的魔女（前篇）?
546?雾中尖叫的魔女（后篇）?
547?与犯人***度的两天（第一天）◆?
548?与犯人***度的两天（第二天）◆?
549?回转寿司之谜（前篇）?
550?回转寿司之谜（后篇）?
551?犯人是元太的父亲（前篇）?
552?犯人是元太的父亲（后篇）?
553?THE?问讯室◆?
554?鹳的探索之旅（搜索小兰篇）◆?X?
555?鹳的探索之旅（追踪阳菜篇）◆?X?
556?恐怖的交叉路口◆?
557?与危险的二人同行?
558?死亡之馆?赤壁（三顾之礼）?
559?死亡之馆?赤壁（掌中之物）?
560?死亡之馆?赤壁（死者孔明）?
561?死亡之馆?赤壁（空城之计）?
注：1、带“★”表示1小时以上的特别篇，带“◆”表示动画原创（即漫画原作中没有的），B表示出现黑衣组织，F表示出现FBI，C表示出现CIA，S表示出现工藤新一，X表示出现服部平次，K表示出现怪盗基德。2、电视上播放的动画顺序与DVD版的收录顺序并不一致，该列表以电视播放顺序为准[4]。3、爱奇艺网将柯南国语版动画中的特别篇进行了拆分，因此与日语版有差异。
我只发到了09年的，因为有字数限制，望采纳。