名侦探柯南508后的剧情
509 红白黄色与侦探团 （赤白黄色と探侦団） 2008/07/14 ┣漫画第60卷.File3-4┫
柯南、哀和少年侦探团接到了1年级A班的杉浦开人的委托。开人的父亲是木马庄公寓的所有人，公寓里的3个住户中，有一个人很可疑，所以，希望侦探团能够阻止他做坏事。第二天，柯南他们来到木马庄公寓，却发现公寓在一场火灾中付之一炬。在火灾后的废墟内，柯南他们发现了开人的日记。在开人的日记中，开人把这3个住户分别记录为红、白、黄色。从日记的内容来看，黄色的人是纵火者…。
510 W暗号之谜(W暗号ミステリー) 2008/07/28 ┣漫画第60卷.File5 and 漫画第61卷.File8┫
放火烧毁木马庄的嫌疑犯有三人，分别是细井、冲矢、真壁。柯南解读了开人的日记，识破了犯人的真面目。之后，有一位原本住在木马庄的住户，决定在找到新住所之前，暂时借住工藤家。几天后，兰和园子一起去工藤家打扫房间，遇见了这个人。园子认为这个人有一定的推理能力，便向兰提议让他和新一决一胜负。于是，两个人的推理对决揭开了帷幕…。
511 推理対决！新一VS冲矢昴(推理对决！新一VS冲矢昴) 2008/08/04 ┣漫画第61卷.File9-10┫
柯南从兰那里收到了邮件，关于新的纸飞机的图像。柯南认为纸飞机上的图案是摩斯电码 。冲矢也推理出飞出纸飞机的人被囚禁在手机服务区外。之后，电视里报道了逃逸中的绑架犯已自杀的新闻。但是，被绑架的造船会社社长依旧行踪不明。冲矢推理认为那位社长是为了避开凶手的监视才放飞纸飞机的…。
512 破碎的十二星座图 （砕けたホロスコープ） 2008/08/11 ┣动画原创┫
杂志的企划安排了小五郎和占卜师紫条丽华谈话，编辑田村雅生、星空出版社社长葛城健辅、柯南、兰也在现场。谈话结束后，女演员绿川来找紫条丽华占卜。之后，紫条丽华为了占卜小五郎的命运，一个人呆在2楼的房间里。当夜，紫条丽华一直没有出现，柯南他们非常担心，便从阳台上窥探紫条丽华的房间，竟然发现紫条丽华倒在血泊中...
513~514 杀意源自咖啡之香（杀意はコーヒーの香り）┣漫画第60卷.File9-11┫2008/09/01 2008/09/08
毛利小五郎接到制作会社社长染井的委托，将要出演侦探24小时零距离接触的电视节目。之后，为了洽谈节目的制作，小五郎、柯南、兰和染井一起来到了东都TV制作人中目赖策的公寓。可是，按了好久的门铃，也没有人来开门。染井说，最近中目的情绪不太好，说过想自杀，出于担心染井的生命安全，他向公寓管理员借了钥匙，开门而入，发现染井竟然已经死在了家中…。
TV制作人中目在自己家中被毒杀了，是一起密室杀人事件。高木询问了染井的下属后，得知案发时间染井在制作公司附近的药店。据药店的店员称，当时，分别有小五郎和舞子小姐打电话给染井。之后，柯南注意到桌子上蛋糕的切痕以及从植物盆栽飘出的咖啡香，确定了染井率先进入这个房间的目的…。
515 怪盗基德的瞬间移动魔术（怪盗キッドの瞬间移动魔术）2008/10/20 ┣漫画第61卷.File1-4┫
（1小时特别篇）
园子的叔父铃木次郎吉计划拿出传说中的“紫红之履”水晶鞋诱捕怪盗基德，他想到基德总是在高空出没，便心生一计----将“紫红之履”放在东京银座的十字路口进行展示。在柯南等众多围观群众无数双眼睛的注视下，身背滑翔机的基德出现在十字路口的上空，随后，降落在展示台上。铃木次郎吉立刻向手下的工作人员发出指令，瞬间，十字路口出现了一张四角大网，网高20米左右，把基德围了起来。铃木次郎吉自信必胜无疑，没想到基德从容不迫地拿到了水晶鞋，还宣称要表演瞬间移动的魔术
516 风林火山 迷宫的铠甲武士 (风林火山 迷宫の铠武者) 2008/11/03 ┣漫画第59卷.File5-10┫（1小时特别篇）
小五郎带着柯南、兰前去拜访居住在长野县的虎田家，从当家人虎田直信那里听说了他儿子义郎摔死的事情。直信的妻子达荣认为，儿子的死与虎田家的仇家龙尾家有关。另一边，在龙尾家，远道而来的平次和和叶从龙尾家的当家人龙尾为史处听说了其儿子康司被打死的事情。为史的母亲盛戴认为，孙子的死与仇家虎田家有关。分别受到两家人委托的柯南和平次再次相见，并***同追查事件的真相。可是，在柯南和平次找出犯人之前，又发生了新的杀人事件…。
517 风林火山 阴与雷光的终结 (风林火山 阴と雷光の决着) 2008/11/10 ┣漫画第59卷.File5-10┫
这次死去的是繁次。繁次是触电身亡的，意味着“风林火山”中的“火”「火」。大家都认为，以“风林火山”为杀人手法的连续杀人事件到此结束了。之后，在铁道旁发现了记录着寻找宝藏的过程的记事本，记事本同时也是交换日记本，上面记录着6年前误杀甲斐的事实！由此，敢助推理出，繁次就是这一连串杀人事件的真凶，他为了将6年前事件的真相永远地掩埋起来，不惜杀死了当年的3个同伙，最后又了结了自己的生命...
518 明治维新神秘之旅（探索篇）（明治维新ミステリーツアー（探索编）） 2008/12/01 ┣动画原创┫
小早川公子希望获知祖父遗留下的日记为何成为抢夺目标的理由，便委托小五郎进行调查。柯南发现日记隐藏着一段“11月30日，黄昏时分才能映出宝藏的真相。才能解开狐狸的谜题”的暗号。很巧合的是11月30日正好是次日。据说祖父生前，拥有富可敌国的财宝。柯南等人为了破解暗号，决定前往公子的娘家，位于岛根的津和野…。
519 明治维新神秘之旅（解读篇）（明治维新ミステリーツアー（解読编）） 2008/12/08 ┣动画原创┫
柯南他们一行人，解读公子的祖父所留下的日记本上的暗号，寻找宝物。途中，公子、光彦、哀他们被蒙面男子绑架。为了同伴的安全，柯南解开了一个又一个暗号，终于找到了装着宝物的木箱。此时，蒙面男子出现，并以光彦他们为人质，要求柯南把木箱递给他。柯南向小五郎发射了麻醉枪，开始了推理…。
520 红酒的告发 （ワインレッドの告発）2008/12/15 ┣动画原创┫
柯南和小五郎一行人为了祝贺日本葡萄酒协会会长广濑先生七十寿辰，前往会社社长本城的山庄。晚宴前，柯南和兰决定一起乘坐索道前往山顶，在山庄外看到了本城和翻译家赤丸正在争吵的身影。之后，柯南在前往山顶的缆车中，目睹了本城手持砖块砸向赤丸头部的犯罪行径！从缆车上下来后，柯南调查了山庄及其周边，却找不到赤丸的尸体…。