明朝在北京一套六部，在南京一套六部，请问南京六部平时做什么呢？

明朝施行两京制，而且有两套几乎一模一样的朝廷机构，一套在北一套在南，虽然明朝南京的六部没有北京的六部那么繁忙，但却也并不是摆设，都有自己的职责。

南京是江南地区最重要的城市之一，历史上定都在此的政权颇多，朱元璋参加反元起义时，其帐下谋士冯国用就曾建议将来定都金陵。

金陵，也就是南京，乃是龙盘虎踞之地，千古帝王之都，而且两宋开始，江浙地区的经济冠绝天下，占据金陵就等于坐拥江浙的财富，这对于一个王朝的诞生、崛起与兴盛是非常重要的。

不过，由于历史上定都在南京的朝代往往都存在得比较仓促，而且对于明朝广袤的疆域来说，南京的地理位置有点偏南，不足以辐射稳定全国，所以朱元璋也并非没考虑过迁都，朱元璋想来想去，选定了北平、西安与洛阳三个地方做备选，但最终由于朱元璋还没来得及想好就突然驾崩，迁都的事情也就没有进行。

靖难之变后，朱棣最终决定将都城迁离南京，迁至北平，而他这么做也很简单：

一，朱棣夺位，抽走了北方大量的明朝精锐，使得大宁、东胜等诸卫内迁，防卫空虚，明朝北方的界限大幅后退，而朱棣以自身为鉴，不放心藩王与将军镇守，所以干脆迁都北平，由自己亲自镇守北方，形成所谓的天子守国门；

二，北平毕竟是朱棣的“龙兴之地”，而南京的前朝势力非常强大，朱棣在南京总是觉得比较不自在，将都城迁到北平，对于朱棣巩固自身的皇位是有好处的，而朱棣也想借此给自己继位一个合理的理由，所谓“自昔帝王，或起布衣，平定天下，或外藩入承大统，而于肇迹之地，皆有升崇”。

朱棣虽然将都城迁到了北平，并且将其改名北京，但依旧保留了南京的地位，只是将南京改为留都，而迁都的过程并非一蹴而就，期间还有很多事情需要处理，因此南京的六部等机构并没有裁撤，迁都完成以后，南京的诸司衙门实际权限大幅削减，但仍旧被保留。

永乐后期开始，所有南京诸司衙门的行文署名前面，都加上“南京”两个字，形成了独具明朝特色的南京六部。

按照规制，南京六部各部设尚书一人，左右侍郎各一人，不过南京的吏部没有员外郎，有时候南京的六部也不设左侍郎只有右侍郎，但除此以外，南京六部的机构架设，与北京的六部基本无二，相差无几。